Не, вынесенный в заголовок темы тезис - лишь предположение. Не копал пока ничего, только сделал на скорую руку скринкаст, который и предлагаю вашему вниманию... впечатление на первый взгляд, как видите, именно такое: девственно чистая страничка дефолтного компонента Joomla, и так происходит ровно до тех самых пор, пока не удалишь весь кэш, зайдя в админку Joomla. После этого все опять какое-то время начинает работать. Некорректно обрабатывается прогрессивное кэширование? Известил джумлаводов-девелоперов, посмотрим... странный баг какой-то.